Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms