Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCDC1P59894 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms