Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP107P57740 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms