Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBASH3AP57075 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms