Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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