Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMSP52788 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMSP52788 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMSP52788 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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