Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGER3P43115 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms