Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms