Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms