Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms