Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GNB3P16520 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms