Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSP16219 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSP16219 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms