Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI2P10070 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI2P10070 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI2P10070 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GLI2P10070 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI2P10070 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms