Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CT47B1P0C2W7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CT47B1P0C2W7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CT47B1P0C2W7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CT47B1P0C2W7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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