Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC175P0C221 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms