Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJB1P08034 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms