Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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