Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms