Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.626e-8■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 515.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 PRPF38B-204ENST00000467302 2043 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 102.3
SF3B1O75533 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 102.2
SF3B1O75533 AL033504.1-203ENST00000442094 404 ntTSL 31.27□□□□□ -2.211e-6■■■■■ 102.1
SF3B1O75533 STARD7-202ENST00000443962 742 ntTSL 521.05■□□□□ 0.968e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 CRTC3-206ENST00000558619 593 ntTSL 419■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 218.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 KIFC3-229ENST00000567059 509 ntTSL 318.63■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 CRTC3-212ENST00000561218 579 ntTSL 318.01■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 317.91■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 WDPCP-207ENST00000409835 2277 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 CRTC3-210ENST00000560927 2463 ntTSL 215□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 WDPCP-208ENST00000417238 2883 ntTSL 210.64□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.495e-13■■■■■ 102
SF3B1O75533 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.495e-13■■■■■ 102
SF3B1O75533 STARD7-205ENST00000488084 384 ntTSL 23.74□□□□□ -1.818e-7■■■■■ 102
SF3B1O75533 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.083e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.053e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 DLG1-214ENST00000447466 858 ntTSL 1 (best)6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 102
SF3B1O75533 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 MAPK15-206ENST00000484654 2240 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.485e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 416.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 101.9
SF3B1O75533 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 101.8
SF3B1O75533 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 101.8
SF3B1O75533 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 101.8
SF3B1O75533 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 53.93□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 315.57■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-212ENST00000614420 2631 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-213ENST00000620366 2452 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 KIAA1191-203ENST00000393728 2243 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 423.18■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 323.18■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 518.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 101.7
SF3B1O75533 SH3BP5-209ENST00000465894 532 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 101.6
SF3B1O75533 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-203ENST00000504525 1011 ntTSL 325.05■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.544e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 CBFA2T3-205ENST00000563856 2380 ntTSL 219.39■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-208ENST00000513939 519 ntTSL 210.25□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 NETO2-205ENST00000564667 799 ntTSL 47.39□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 NETO2-203ENST00000562559 1327 ntTSL 37.02□□□□□ -1.294e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 NETO2-204ENST00000563078 581 ntTSL 35.79□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-205ENST00000505294 847 ntTSL 35.74□□□□□ -1.494e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 GCLC-211ENST00000514933 542 ntTSL 54.69□□□□□ -1.664e-6■■■■■ 101.5
SF3B1O75533 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 101.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1144.9 ms