Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CREB3O43889 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms