Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms