Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms