Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CCDC179H3BU77 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms