Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CD8B2A6NJW9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD8B2A6NJW9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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