Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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