Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC144AA2RUR9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms