Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms