Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms