Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms