Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASF1AQ9Y294 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms