Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms