Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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