Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLIP2Q9UDT6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms