Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms