Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MIS18AQ9NYP9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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