Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMRT3Q9NQL9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms