Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms