Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms