Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms