Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNPPD1Q9BV87 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms