Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms