Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL2Q969S2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms