Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA4DQ92854 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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