Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms