Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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