Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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