Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKL3Q8IVW4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms