Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6P435 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q6P435 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q6P435 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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