Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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