Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIN4Q56A73 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms